考慮到海上風險的不可避免性，航運公司可以通過保險，交付一定的保費，以保證收取運費的權利。
對于第二方面的風險，航運公司可采取以下防范措施：
第一，必須重視對托運人或租船人的資信調查。對于資信較好的托運人或租船人可以予以信任，對運費支付條件可以放松一點，以求和客戶保持長期、穩定、良好的合作關系。而對于規模較小、償付能力有限、資信不良的公司則應把好關。當運費被托欠時，航運公司應及時采取措施，贏得主動，以保全運費的回收?？紤]到議付行審核 單證 需要一段時間，如中國銀行審單時間為7天左右，在買賣合同 信用證 項下的貨款還沒有支出時，航運公司可以申請當地司法機關，對銀行賬戶予以查封、凍結，從而請求法院判決要求債務人支付其拖欠的運費。
第二，在信用證 交易情況下，航運公司可以要求托運人或租船人開具以原交易的信用證議付行為開證行、航運公司為受益人的信用證，或提供議付行出具的保證其支付運費的保函。由于托運人或租船人是前一信用證的受益人，可以憑前一信用證作擔保，開具以議付行為開證行、航運公司為受益人的信用證，銀行承擔第一性的付款義務，把商業信用轉為銀行信用，或者提供議付行出具的保函。因為托運人或租船人有信用證作擔保，他也不需要再交開證押金，要求議付行開信用證僅僅需要支付一些手續費而己。同樣，對于要求議付行出保函也易取得議付行的同意。
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